[ nabia ]
[ aramo ]
[ Pakiet źródłowy: stringtie ]
Pakiet: stringtie (2.1.1+ds-2)
Odnośniki dla stringtie
Zasoby systemu Trisquel:
- Install using apturl
- Entry at directory.fsf.org
- Raporty o błędach
- Changelog
- Informacje nt. praw autorskich
Pobieranie pakietu źródłowego stringtie:
Opiekun:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
- Steffen Moeller
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [ccb.jhu.edu]
Podobne pakiety:
assemble short RNAseq reads to transcripts
The abundance of transcripts in a human tissue sample can be determined by RNA sequencing. The exact sequence sampled may be random, depending on the technology used. And it may be short, i.e. shorter than the transcript. At some point, many shorter reads need to be assembled to the model the complete transcripts.
StringTie knows how to assemble of RNA-Seq into potential transcripts without the need of a reference genome and provides a quantification also of the splice variants.
Inne pakiety związane z stringtie
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- compression library - runtime
Pobieranie stringtie
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| amd64 | 396,2 KiB | 1047 KiB | [lista plików] |
| armhf | 344,8 KiB | 674 KiB | [lista plików] |