Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paket >> aramo >> science >> ssw-align
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Källkod: libssw  ]

Paket: ssw-align (1.1-13)

Länkar för ssw-align

ssw-align

Trisquelresurser:

Hämta källkodspaketet libssw:

Ansvarig:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-postarkiv)
  • Sascha Steinbiss
  • Michael R. Crusoe

Externa resurser:

Liknande paket:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andra paket besläktade med ssw-align

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
  • dep: libssw0 (= 1.1-13)
    fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Hämta ssw-align

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 19,1 kbyte55 kbyte [filförteckning]
arm64 18,1 kbyte54 kbyte [filförteckning]
armhf 20,3 kbyte50 kbyte [filförteckning]
ppc64el 21,2 kbyte83 kbyte [filförteckning]