Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> ssw-align
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: libssw  ]

Pakiet: ssw-align (1.1-13)

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Inne pakiety związane z ssw-align

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libssw0 (= 1.1-13)
    fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Pobieranie ssw-align

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 19,1 KiB55 KiB [lista plików]
arm64 18,1 KiB54 KiB [lista plików]
armhf 20,3 KiB50 KiB [lista plików]
ppc64el 21,2 KiB83 KiB [lista plików]