[ ソース: libssw ]
パッケージ: ssw-align (1.1-13)
ssw-align に関するリンク
Trisquel の資源:
libssw ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)
- Sascha Steinbiss
- Michael R. Crusoe
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
Smith-Waterman aligner based on libssw
This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.
その他の ssw-align 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C Library: Shared libraries
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libssw0 (= 1.1-13)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime