Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paketit >> aramo >> science >> ssw-align
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Source: libssw  ]

Paketti: ssw-align (1.1-13)

Links for ssw-align

ssw-align

Trisquel-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti libssw:

Ylläpitäjä:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Mail Archive)
  • Sascha Steinbiss
  • Michael R. Crusoe

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Muut pakettiin ssw-align liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
  • dep: libssw0 (= 1.1-13)
    fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Imuroi ssw-align

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
amd64 19.1 kt55 kt [tiedostoluettelo]
arm64 18.1 kt54 kt [tiedostoluettelo]
armhf 20.3 kt50 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 21.2 kt83 kt [tiedostoluettelo]