[  etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]

[ Источник: circlator  ]

Ссылки для circlator

Ресурсы Trisquel:

• Install using apturl
• Entry at directory.fsf.org
• Сообщения об ошибках
• Changelog
• Файл авторских прав

Исходный код circlator:

• [circlator_1.5.5-1.dsc]
• [circlator_1.5.5.orig.tar.gz]
• [circlator_1.5.5-1.debian.tar.xz]

Сопровождающий:

• Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)

Original Maintainers:

• Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
• Afif Elghraoui

Внешние ресурсы:

• Сайт [sanger-pathogens.github.io]

Подобные пакеты:

• unicycler
• plasmidseeker
• unicycler-data
• busco
• metaphlan2
• plasmidid
• metaphlan2-data
• soapdenovo2
• parsnp
• soapdenovo
• shasta

Другие пакеты, относящиеся к circlator

зависимости

рекомендации

предложения

• dep: bwa (>= 0.7.12)

  Burrows-Wheeler Aligner

• dep: fastaq (>= 3.12.1)

  FASTA and FASTQ file manipulation tools

• dep: mummer

  Efficient sequence alignment of full genomes

• dep: prodigal

  Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-openpyxl

  Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files

• dep: python3-pymummer (>= 0.9.0)

  Python 3 interface to MUMmer

• dep: python3-pysam (>= 0.8.1)

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM and BAM formats

• dep: spades

  genome assembler for single-cell and isolates data sets

• sug: canu

  single molecule sequence assembler for genomes

Загрузка circlator

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	4 225,1 Кб	10301 Кб	[список файлов]