[  etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]

[ Pakiet źródłowy: circlator  ]

Odnośniki dla circlator

Zasoby systemu Trisquel:

• Install using apturl
• Entry at directory.fsf.org
• Raporty o błędach
• Changelog
• Informacje nt. praw autorskich

Pobieranie pakietu źródłowego circlator:

• [circlator_1.5.5-1.dsc]
• [circlator_1.5.5.orig.tar.gz]
• [circlator_1.5.5-1.debian.tar.xz]

Opiekun:

• Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Original Maintainers:

• Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
• Afif Elghraoui

Zasoby zewnętrzne:

• Strona internetowa [sanger-pathogens.github.io]

Podobne pakiety:

• unicycler
• plasmidseeker
• unicycler-data
• busco
• metaphlan2
• plasmidid
• metaphlan2-data
• soapdenovo2
• parsnp
• soapdenovo
• shasta

Inne pakiety związane z circlator

wymaga

poleca

sugeruje

• dep: bwa (>= 0.7.12)

  Burrows-Wheeler Aligner

• dep: fastaq (>= 3.12.1)

  FASTA and FASTQ file manipulation tools

• dep: mummer

  Efficient sequence alignment of full genomes

• dep: prodigal

  Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-openpyxl

  Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files

• dep: python3-pymummer (>= 0.9.0)

  Python 3 interface to MUMmer

• dep: python3-pysam (>= 0.8.1)

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM and BAM formats

• dep: spades

  genome assembler for single-cell and isolates data sets

• sug: canu

  single molecule sequence assembler for genomes

Pobieranie circlator

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	4 225,1 KiB	10301 KiB	[lista plików]