[ Источник: srst2 ]
Пакет: srst2 (0.2.0-9)
Ссылки для srst2
Ресурсы Trisquel:
Исходный код srst2:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Andreas Tille
- Étienne Mollier
Внешние ресурсы:
- Сайт [katholt.github.io]
Подобные пакеты:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Другие пакеты, относящиеся к srst2
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
также виртуальный пакет, предоставляемый python3-rpy2
Загрузка srst2
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 61,2 Кб | 254 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 61,2 Кб | 254 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 61,2 Кб | 254 Кб | [список файлов] |