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[ Paquet source : dascrubber  ]

Paquet : dascrubber (1.1-4)

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to 

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).
Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
  • sug: daligner
    local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads
  • sug: dazzdb
    manage nucleotide sequencing read data

Télécharger dascrubber

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 109,7 ko385 ko [liste des fichiers]
arm64 109,8 ko345 ko [liste des fichiers]
armhf 158,5 ko799 ko [liste des fichiers]
ppc64el 123,1 ko765 ko [liste des fichiers]