Paket: dascrubber (1.1-4)

Links für dascrubber

Trisquel-Ressourcen:

Quellcode-Paket dascrubber herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (E-Mail-Archiv)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (E-Mail-Archiv)
Andreas Tille

Externe Ressourcen:

Homepage [dazzlerblog.wordpress.com]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Andere Pakete mit Bezug zu dascrubber

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

sug: daligner

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

dascrubber herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	109,7 kB	385 kB	[Liste der Dateien]
arm64	109,8 kB	345 kB	[Liste der Dateien]
armhf	158,5 kB	799 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	123,1 kB	765 kB	[Liste der Dateien]

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