Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> dascrubber
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: dascrubber  ]

Pakiet: dascrubber (1.1-4)

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).
Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Inne pakiety związane z dascrubber

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • sug: daligner
    local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads
  • sug: dazzdb
    manage nucleotide sequencing read data

Pobieranie dascrubber

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 109,7 KiB385 KiB [lista plików]
arm64 109,8 KiB345 KiB [lista plików]
armhf 158,5 KiB799 KiB [lista plików]
ppc64el 123,1 KiB765 KiB [lista plików]