Paquet : dascrubber (0~20180108-1)

Liens pour dascrubber

Ressources Trisquel :

Télécharger le paquet source dascrubber :

Responsable :

Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)
Afif Elghraoui

Ressources externes :

Page d'accueil [dazzlerblog.wordpress.com]

Paquets similaires :

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

dépendances

recommandations

suggestions

dep: libc6 (>= 2.7)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

sug: daligner

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

Télécharger dascrubber

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	147,1 ko	982 ko	[liste des fichiers]
i386	142,0 ko	1066 ko	[liste des fichiers]

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