Пакет: unicycler (0.4.8+dfsg-2build1)

Ссылки для unicycler

Ресурсы Trisquel:

• Install using apturl
• Entry at directory.fsf.org
• Сообщения об ошибках
• Changelog
• Файл авторских прав

Исходный код unicycler:

• [unicycler_0.4.8+dfsg-2build1.dsc]
• [unicycler_0.4.8+dfsg.orig.tar.xz]
• [unicycler_0.4.8+dfsg-2build1.debian.tar.xz]

Сопровождающий:

• Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)

Original Maintainers:

• Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
• Andreas Tille
• Liubov Chuprikova

Внешние ресурсы:

• Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

• spades
• shovill
• minimap2
• pbjelly
• python3-mappy
• skesa
• libminimap2-dev
• wtdbg2-examples
• canu
• wtdbg2
• pbsim

Другие пакеты, относящиеся к unicycler

• dep: bcftools

  genomic variant calling and manipulation of VCF/BCF files

• dep: bowtie2

  ultrafast memory-efficient short read aligner

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 6)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: miniasm

  ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: pilon

  automated genome assembly improvement and variant detection tool

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

• dep: python3-setuptools

  Python3 Distutils Enhancements

• dep: racon

  consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• dep: spades (>= 3.13.1)

  genome assembler for single-cell and isolates data sets

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• rec: unicycler-data

  hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)

Загрузка unicycler