Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> fml-asm
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: fermi-lite  ]

Пакет: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1)

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Другие пакеты, относящиеся к fml-asm

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Загрузка fml-asm

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 66,8 Кб159 Кб [список файлов]
arm64 61,1 Кб143 Кб [список файлов]
armhf 66,1 Кб118 Кб [список файлов]
ppc64el 75,8 Кб211 Кб [список файлов]