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[ ソース: fermi-lite  ]

パッケージ: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1)

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

その他の fml-asm 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

fml-asm のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 66.8 kB159 kB [ファイル一覧]
arm64 61.1 kB143 kB [ファイル一覧]
armhf 66.1 kB118 kB [ファイル一覧]
ppc64el 75.8 kB211 kB [ファイル一覧]