Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> science >> zalign
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Източник: zalign  ]

Пакет: zalign (0.9.1-5)

Връзки за zalign

zalign

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник zalign.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Други пакети, свързани с zalign

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libopenmpi3 (>= 4.0.3)
    high performance message passing library -- shared library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.9)
    GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на zalign

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 47,5 кБ279 кБ [списък на файловете]
arm64 45,1 кБ263 кБ [списък на файловете]
armhf 25,7 кБ97 кБ [списък на файловете]
ppc64el 51,1 кБ415 кБ [списък на файловете]