Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> zalign
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: zalign  ]

Pakiet: zalign (0.9.1-5)

Odnośniki dla zalign

zalign

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego zalign:

Opiekun:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
  • Steffen Moeller
  • Andreas Tille

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Inne pakiety związane z zalign

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libopenmpi3 (>= 4.0.3)
    high performance message passing library -- shared library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.9)
    GNU Standard C++ Library v3

Pobieranie zalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 47,5 KiB279 KiB [lista plików]
arm64 45,1 KiB263 KiB [lista plików]
armhf 25,7 KiB97 KiB [lista plików]
ppc64el 51,1 KiB415 KiB [lista plików]