Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> science >> skewer
nabia  ] [  aramo  ]
[ Източник: skewer  ]

Пакет: skewer (0.2.2-6)

Връзки за skewer

skewer

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник skewer.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Други пакети, свързани с skewer

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на skewer

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 87,6 кБ197 кБ [списък на файловете]
arm64 80,7 кБ165 кБ [списък на файловете]
armhf 82,5 кБ146 кБ [списък на файловете]
ppc64el 87,6 кБ229 кБ [списък на файловете]