Пакет: skewer (0.2.2-6)

Ссылки для skewer

Ресурсы Trisquel:

Исходный код skewer:

Сопровождающий:

Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
Steffen Moeller

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Другие пакеты, относящиеся к skewer

зависимости

рекомендации

предложения

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armhf]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3

Загрузка skewer

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	87,6 Кб	197 Кб	[список файлов]
arm64	80,7 Кб	165 Кб	[список файлов]
armhf	82,5 Кб	146 Кб	[список файлов]
ppc64el	87,6 Кб	229 Кб	[список файлов]

Sections