[ Източник: bitseq ]
Пакет: bitseq (0.7.5+dfsg-6)
Връзки за bitseq
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник bitseq.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Tim Booth
- Andreas Tille
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data
BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.
Други пакети, свързани с bitseq
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- compression library - runtime
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Изтегляне на bitseq
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 358,0 кБ | 1507 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 335,9 кБ | 1291 кБ | [списък на файловете] |
| armhf | 329,0 кБ | 1154 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 390,7 кБ | 2087 кБ | [списък на файловете] |