Пакет: tophat-recondition (1.4-3)

Връзки за tophat-recondition

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник tophat-recondition.

Отговорник:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
Steffen Moeller
Michael R. Crusoe

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

post-processor for TopHat unmapped reads

tophat-recondition is a post-processor for TopHat unmapped reads (contained in unmapped.bam), making them compatible with downstream tools (e.g., the Picard suite, samtools, GATK) (TopHat issue #17). It also works around bugs in TopHat:

 * the "mate is unmapped" SAM flag is not set on any reads in the
   unmapped.bam file (TopHat issue #3)
 * the mapped mate of an unmapped read can be absent from
   accepted_hits.bam, creating a mismatch between the file and the unmapped
   read's flags (TopHat issue #16)

Други пакети, свързани с tophat-recondition

зависимости

препоръчани

предложени

dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: tophat2

Пакетът не е наличен

Изтегляне на tophat-recondition

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
all	9,4 кБ	34 кБ	[списък на файловете]

Sections