[ Zdroj: srst2 ]
Balík: srst2 (0.2.0-9)
Odkazy pre srst2
Zdroje Trisquel:
Stiahnuť zdrojový balík srst2:
Správca:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Konferencia)
- Andreas Tille
- Étienne Mollier
Externé zdroje:
- Domovská stránka [katholt.github.io]
Podobné balíky:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom srst2
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom python3-rpy2
Stiahnuť srst2
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| amd64 | 61.2 kB | 254 kB | [zoznam súborov] |