[ Paquet source : srst2 ]
Paquet : srst2 (0.2.0-9)
Liens pour srst2
Ressources Trisquel :
Télécharger le paquet source srst2 :
Responsable :
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille
- Étienne Mollier
Ressources externes :
- Page d'accueil [katholt.github.io]
Paquets similaires :
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Autres paquets associés à srst2
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- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
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- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
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- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
un paquet virtuel est également fourni par python3-rpy2
Télécharger srst2
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 61,2 ko | 254 ko | [liste des fichiers] |