Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> bamclipper
aramo  ]
[ Zdroj: bamclipper  ]

Balík: bamclipper (1.0.0-2)

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments of PCR amplicons by soft-clipping.

bamclipper.sh soft-clips gene-specific primers from BAM alignment file based on genomic coordinates of primer pairs in BEDPE format.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bamclipper

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • dep: parallel
    build and execute command lines from standard input in parallel
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Stiahnuť bamclipper

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
all 6.0 kB29 kB [zoznam súborov]