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パッケージ: bamclipper (1.0.0-2)

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bamclipper

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類似のパッケージ:

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments of PCR amplicons by soft-clipping.

bamclipper.sh soft-clips gene-specific primers from BAM alignment file based on genomic coordinates of primer pairs in BEDPE format.

その他の bamclipper 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: parallel
    build and execute command lines from standard input in parallel
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

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