Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> etiona >> science >> ssw-align
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: libssw  ]

Пакет: ssw-align (1.1-1)

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Другие пакеты, относящиеся к ssw-align

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.14)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libssw0 (= 1.1-1)
    fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Загрузка ssw-align

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 11,7 Кб37 Кб [список файлов]