Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> mafft
[  etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: mafft  ]

Пакет: mafft (7.490-1)

Ссылки для mafft

mafft

Ресурсы Trisquel:

Исходный код mafft:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods: 

 * L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences;
   iterative refinement method incorporating local pairwise alignment
   information),
 * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for
   <200 sequences; iterative refinement method incorporating global
   pairwise alignment information),
 * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions;
   recommended for <200 sequences),
and five speed-oriented methods: 
 * FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only),
 * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations),
 * FFT-NS-2 (fast; progressive method),
 * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive
   method with a rough guide tree),
 * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive
   method with the PartTree algorithm).

Другие пакеты, относящиеся к mafft

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • rec: blast2
    Пакет недоступен
  • rec: libwww-perl
    simple and consistent interface to the world-wide web
  • rec: lynx
    classic non-graphical (text-mode) web browser
  • rec: ruby
    Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
  • enh: t-coffee
    Multiple Sequence Alignment

Загрузка mafft

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 757,5 Кб3665 Кб [список файлов]
arm64 716,7 Кб3259 Кб [список файлов]
armhf 894,2 Кб7645 Кб [список файлов]
ppc64el 951,7 Кб6090 Кб [список файлов]