Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> bowtie
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: bowtie  ]

Пакет: bowtie (1.3.1-1)

Ссылки для bowtie

bowtie

Ресурсы Trisquel:

Исходный код bowtie:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
  • Steffen Moeller
  • Andreas Tille
  • Ognyan Kulev
  • Stephan Struckmann
  • Alexandre Mestiashvili

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Другие пакеты, относящиеся к bowtie

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 11) [не ppc64el]
    GNU Standard C++ Library v3
    dep: libstdc++6 (>= 9) [ppc64el]
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
    compression library - runtime
  • sug: bowtie-examples
    Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

Загрузка bowtie

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 1 559,7 Кб5827 Кб [список файлов]
arm64 1 316,2 Кб4980 Кб [список файлов]
ppc64el 1 577,3 Кб7424 Кб [список файлов]