Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> etiona >> science >> probalign
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: probalign  ]

Pakiet: probalign (1.4-7)

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Inne pakiety związane z probalign

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.4) [i386]
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

Pobieranie probalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 63,4 KiB163 KiB [lista plików]
i386 61,1 KiB154 KiB [lista plików]