Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> etiona >> science >> daligner
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: daligner  ]

Pakiet: daligner (1.0+20180108-1)

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Inne pakiety związane z daligner

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [i386]
  • sug: dascrubber
    alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
  • sug: dazzdb
    manage nucleotide sequencing read data

Pobieranie daligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 171,8 KiB1139 KiB [lista plików]
i386 167,7 KiB1241 KiB [lista plików]