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[ ソース: daligner  ]

パッケージ: daligner (1.0+20180108-1)

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

その他の daligner 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [i386]
  • sug: dascrubber
    alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
  • sug: dazzdb
    manage nucleotide sequencing read data

daligner のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 171.8 kB1139 kB [ファイル一覧]
i386 167.7 kB1241 kB [ファイル一覧]