Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> python >> python3-pyspoa
aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: python-pyspoa  ]

Pakiet: python3-pyspoa (0.0.8-2build1)

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Inne pakiety związane z python3-pyspoa

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]
    SIMD partial order alignment library
    dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [nie amd64]
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3 (<< 3.11)
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (>= 3.10~)
  • dep: python3-pybind11
    pybind11 helper module for Python 3

Pobieranie python3-pyspoa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 48,6 KiB134 KiB [lista plików]
arm64 45,6 KiB114 KiB [lista plików]
armhf 44,8 KiB93 KiB [lista plików]
ppc64el 53,3 KiB150 KiB [lista plików]