ソースパッケージ: cnvkit (0.9.6-3)

cnvkit に関するリンク

Trisquel の資源:

• バグ報告
• Changelog
• 著作権ファイル
• Debian ソースリポジトリ (Git)

メンテナ:

• Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)

Original Maintainers:

• Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)
• Michael R. Crusoe
• Steffen Moeller
• Olivier Sallou

外部の資源:

• ホームページ [cnvkit.readthedocs.org]

cnvkit

Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

その他の cnvkit 関連パッケージ

• adep: debhelper-compat (= 12)

  パッケージは利用できません

• adep: dh-python

  Debian helper tools for packaging Python libraries and applications

• adep: python3-all

  package depending on all supported Python 3 runtime versions

• adep: python3-setuptools

  Python3 Distutils Enhancements

• adep: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• adep: help2man

  Automatic manpage generator

• adep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• adep: python3-pandas

  data structures for "relational" or "labeled" data

• adep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• adep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• adep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• adep: python3-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• adep: python3-pyvcf

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-vcf

• adep: python3-future

  Clean single-source support for Python 3 and 2 - Python 3.x

• adep: python3-pomegranate (>= 0.9.0)

  Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling

• adep: r-bioc-dnacopy

  R package: DNA copy number data analysis

• adep: poppler-utils

  PDF utilities (based on Poppler)

Download cnvkit

Debian パッケージソースリポジトリ (VCS: Git)

https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git

Debian パッケージソースリポジトリ (ブラウザで表示可能)

https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit