Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> nabia >> Източник >> misc >> cnvkit
nabia  ] [  aramo  ]

Пакет-източник: cnvkit (0.9.6-3)

Връзки за cnvkit

Ресурси за Trisquel:

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Следните двоични пакети са компилирани от този пакет-източник:
cnvkit
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

Други пакети, свързани с cnvkit

  • зависимости при компилиране
  • зависимости при компилиране (архитектурно-независими)
  • adep: debhelper-compat (= 12)
    Пакетът не е наличен
  • adep: dh-python
    Debian helper tools for packaging Python libraries and applications
  • adep: python3-all
    package depending on all supported Python 3 runtime versions
  • adep: python3-setuptools
    Python3 Distutils Enhancements
  • adep: python3-pyfaidx
    efficient random access to fasta subsequences for Python 3
  • adep: help2man
    Automatic manpage generator
  • adep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • adep: python3-pandas
    data structures for "relational" or "labeled" data
  • adep: python3-numpy
    Fast array facility to the Python 3 language
  • adep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • adep: python3-scipy
    scientific tools for Python 3
  • adep: python3-matplotlib
    Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
  • adep: python3-pyvcf
    виртуален пакет, предлаган от python3-vcf
  • adep: python3-future
    Clean single-source support for Python 3 and 2 - Python 3.x
  • adep: python3-pomegranate (>= 0.9.0)
    Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
  • adep: r-bioc-dnacopy
    R package: DNA copy number data analysis
  • adep: poppler-utils
    PDF utilities (based on Poppler)

Download cnvkit

ФайлГолемина (в кБ)контролна сума MD5
cnvkit_0.9.6-3.dsc 2,3 кБ 704eed95e9f61d8693e9b80a88732448
cnvkit_0.9.6.orig.tar.gz 23 103,4 кБ 58ad4fe3444c022e72f26481c0b160e7
cnvkit_0.9.6-3.debian.tar.xz 5,7 кБ a5b1ddf57d90ddf098ff6185e0c68ac4
Хранилище на изходния код на пакета (СКП: Git)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
Хранилище на изходния код на пакета (за разглеждане през браузър)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit