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[ ソース: microbiomeutil  ]

パッケージ: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

nast-ier に関するリンク

nast-ier

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外部の資源:

類似のパッケージ:

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

その他の nast-ier 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: cdbfasta
    Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: microbiomeutil-data
    Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
  • rec: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools

nast-ier のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 21.0 kB101 kB [ファイル一覧]
arm64 20.8 kB96 kB [ファイル一覧]
armhf 20.9 kB92 kB [ファイル一覧]
ppc64el 21.6 kB149 kB [ファイル一覧]