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[ Paquet source : microbiomeutil  ]

Paquet : nast-ier (20101212+dfsg1-5)

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Autres paquets associés à nast-ier

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: cdbfasta
    Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
  • dep: microbiomeutil-data
    Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
  • rec: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools

Télécharger nast-ier

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 21,0 ko101 ko [liste des fichiers]
arm64 20,8 ko96 ko [liste des fichiers]
armhf 20,9 ko92 ko [liste des fichiers]
ppc64el 21,6 ko149 ko [liste des fichiers]