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Paquet source : cnvkit (0.9.6-3)

Liens pour cnvkit

Ressources Trisquel :

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Ressources externes :

Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
cnvkit
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

Autres paquets associés à cnvkit

  • build-depends
  • build-depends-indep
  • adep: debhelper-compat (= 12)
    Paquet indisponible
  • adep: dh-python
    Debian helper tools for packaging Python libraries and applications
  • adep: python3-all
    package depending on all supported Python 3 runtime versions
  • adep: python3-setuptools
    Python3 Distutils Enhancements
  • adep: python3-pyfaidx
    efficient random access to fasta subsequences for Python 3
  • adep: help2man
    Automatic manpage generator
  • adep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • adep: python3-pandas
    data structures for "relational" or "labeled" data
  • adep: python3-numpy
    Fast array facility to the Python 3 language
  • adep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • adep: python3-scipy
    scientific tools for Python 3
  • adep: python3-matplotlib
    Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
  • adep: python3-pyvcf
    paquet virtuel fourni par python3-vcf
  • adep: python3-future
    Clean single-source support for Python 3 and 2 - Python 3.x
  • adep: python3-pomegranate (>= 0.9.0)
    Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
  • adep: r-bioc-dnacopy
    R package: DNA copy number data analysis
  • adep: poppler-utils
    PDF utilities (based on Poppler)

Download cnvkit

FichierTaille (en ko)Somme MD5
cnvkit_0.9.6-3.dsc 2,3 ko 704eed95e9f61d8693e9b80a88732448
cnvkit_0.9.6.orig.tar.gz 23 103,4 ko 58ad4fe3444c022e72f26481c0b160e7
cnvkit_0.9.6-3.debian.tar.xz 5,7 ko a5b1ddf57d90ddf098ff6185e0c68ac4
Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
Dépôt Debian des paquets source (interface web)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit