[ aramo ]
[ Източник: sibelia ]
Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-3)
Връзки за sibelia
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник sibelia.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Andreas Tille
Външни препратки:
- Начална страница [bioinf.spbau.ru]
Подобни пакети:
comparative genomics tool
Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.
Sibelia is useful in finding:
1) shared regions, 2) regions that present in one group of genomes but not in others, 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.
Други пакети, свързани с sibelia
|
|
|
-
- dep: lagan
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
-
- dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)
- fast suffix array construction
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armhf]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- sug: sibelia-examples
- comparative genomics tool (example data)
Изтегляне на sibelia
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 312,5 кБ | 1216 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 279,1 кБ | 1124 кБ | [списък на файловете] |
| armhf | 290,7 кБ | 955 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 301,7 кБ | 1228 кБ | [списък на файловете] |