Пакет: python3-pairtools (0.3.0-3.2build1)

Връзки за python3-pairtools

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник pairtools.

Отговорник:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
Antoni Villalonga

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Други пакети, свързани с python3-pairtools

зависимости

препоръчани

предложени

dep: cython3

C-Extensions for Python 3
dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.11)

dep: python3 (>= 3.10~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-nose

test discovery and running for Python3 unittest
dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-numpy-abi9

виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

Изтегляне на python3-pairtools

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
arm64	123,5 кБ	404 кБ	[списък на файловете]

Sections