Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Packages >> aramo-updates >> science >> bedtools
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ] [  aramo-updates  ]
[ Source: bedtools  ]

Пакунок: bedtools (2.30.0+dfsg-2ubuntu0.1)

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Інші пакунки пов'язані з bedtools

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libbz2-1.0
    high-quality block-sorting file compressor library - runtime
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    also a virtual package provided by libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
    dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ppc64el]
  • dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
    XZ-format compression library
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Завантажити bedtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 549.5 kB1512 kB [список файлів]
arm64 519.3 kB1336 kB [список файлів]
armhf 628.2 kB1275 kB [список файлів]
ppc64el 655.7 kB1944 kB [список файлів]