Paket: lagan (2.0-6)
Länkar för lagan
Trisquelresurser:
Hämta källkodspaketet lagan:
Ansvarig:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (E-postarkiv)
- Andreas Tille
- Steffen Moeller
Externa resurser:
- Hemsida [lagan.stanford.edu]
Liknande paket:
highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.
Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.
Andra paket besläktade med lagan
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C Library: Shared libraries
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armhf]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
Hämta lagan
| Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|
| amd64 | 176,5 kbyte | 828 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 169,5 kbyte | 740 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 161,3 kbyte | 565 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 195,0 kbyte | 1888 kbyte | [filförteckning] |