Balík: murasaki (1.68.6-13build1)

Odkazy pre murasaki

Zdroje Trisquel:

Stiahnuť zdrojový balík murasaki:

Správca:

Debian Med Packaging Team (Konferencia)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Konferencia)
Andreas Tille
Nilesh Patra

Externé zdroje:

Domovská stránka [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobné balíky:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki

závisí

odporúča

navrhuje

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-regex1.74.0-icu70

virtuálny balík poskytovaný balíkom libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Stiahnuť murasaki

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	564.2 kB	3184 kB	[zoznam súborov]
arm64	541.2 kB	2927 kB	[zoznam súborov]
armhf	464.6 kB	1761 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	586.7 kB	4171 kB	[zoznam súborov]

Sections