Balík: ggd-utils (1.0.0+ds-1)

Odkazy pre ggd-utils

Zdroje Trisquel:

Stiahnuť zdrojový balík ggd-utils:

Správca:

Debian Med Packaging Team (Konferencia)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Konferencia)
Nilesh Patra

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ggd-utils

závisí

odporúča

navrhuje

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

Stiahnuť ggd-utils

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1,809.6 kB	4933 kB	[zoznam súborov]
arm64	1,633.2 kB	4765 kB	[zoznam súborov]
armhf	1,594.1 kB	4335 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1,519.1 kB	4775 kB	[zoznam súborov]

Sections