Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> spoa
nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: spoa  ]

Пакет: spoa (4.0.7+ds-2)

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Другие пакеты, относящиеся к spoa

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]
    SIMD partial order alignment library
    dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [не amd64]
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Загрузка spoa

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 36,5 Кб82 Кб [список файлов]
arm64 35,8 Кб74 Кб [список файлов]
armhf 33,8 Кб61 Кб [список файлов]
ppc64el 37,9 Кб98 Кб [список файлов]