Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> allelecount
aramo  ]
[ Источник: allelecount  ]

Пакет: allelecount (4.3.0-1.1)

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Другие пакеты, относящиеся к allelecount

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libhts3 (>= 1.10)
    C library for high-throughput sequencing data formats

Загрузка allelecount

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 29,3 Кб89 Кб [список файлов]
arm64 28,6 Кб85 Кб [список файлов]
armhf 27,9 Кб76 Кб [список файлов]
ppc64el 31,4 Кб117 Кб [список файлов]