Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> python >> python3-pairtools
[  aramo  ]
[ Источник: pairtools  ]

Пакет: python3-pairtools (0.3.0-3.2build1)

Ссылки для python3-pairtools

python3-pairtools

Ресурсы Trisquel:

Исходный код pairtools:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Другие пакеты, относящиеся к python3-pairtools

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: cython3
    C-Extensions for Python 3
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (<< 3.11)
    dep: python3 (>= 3.10~)
  • dep: python3-click
    Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
  • dep: python3-nose
    test discovery and running for Python3 unittest
  • dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-numpy-abi9
    виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-pairtools

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 130,0 Кб441 Кб [список файлов]
arm64 123,5 Кб404 Кб [список файлов]
armhf 118,4 Кб338 Кб [список файлов]
ppc64el 146,8 Кб540 Кб [список файлов]