Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> metabat
aramo  ]
[ Источник: metabat  ]

Пакет: metabat (2.15-3)

robust statistical framework for reconstructing genomes from metagenomic data

MetaBAT integrates empirical probabilistic distances of genome abundance and tetranucleotide frequency for accurate metagenome binning. MetaBAT outperforms alternative methods in accuracy and computational efficiency on both synthetic and real metagenome datasets. It automatically forms hundreds of high quality genome bins on a very large assembly consisting millions of contigs in a matter of hours on a single node.

Другие пакеты, относящиеся к metabat

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
    GCC support library
  • dep: libgomp1 (>= 6)
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: libhts3 (>= 1.10)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Загрузка metabat

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 523,6 Кб2026 Кб [список файлов]