Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> deepnano
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: deepnano  ]

Пакет: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3.1build1)

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Другие пакеты, относящиеся к deepnano

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: deepnano-data
    alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-dateutil
    powerful extensions to the standard Python 3 datetime module
  • dep: python3-h5py
    general-purpose Python interface to hdf5
  • dep: python3-numpy
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-theano
    CPU/GPU math expression compiler for Python 3
  • rec: python3-watchdog
    Python API and shell utilities to monitor file system events

Загрузка deepnano

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 20,4 Кб98 Кб [список файлов]
arm64 19,9 Кб90 Кб [список файлов]
armhf 19,2 Кб80 Кб [список файлов]
ppc64el 22,7 Кб194 Кб [список файлов]