Пакет: bio-vcf (0.9.5-3)
Ссылки для bio-vcf
Ресурсы Trisquel:
Исходный код bio-vcf:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Andreas Tille
- Nilesh Patra
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
domain specific language (DSL) for processing the VCF format
Bio-vcf provides a domain specific language (DSL) for processing the VCF format. Record named fields can be queried with regular expressions, e.g.
sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4
Bio-vcf is a new generation VCF parser, filter and converter. Bio-vcf is not only very fast for genome-wide (WGS) data, it also comes with a really nice filtering, evaluation and rewrite language and it can output any type of textual data, including VCF header and contents in RDF and JSON.
Другие пакеты, относящиеся к bio-vcf
|
|
|
-
- dep: ruby
- Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
Загрузка bio-vcf
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
all | 29,2 Кб | 141 Кб | [список файлов] |