Пакет: sspace (2.1.1+dfsg-6)

Ссылки для sspace

Ресурсы Trisquel:

Исходный код sspace:

Сопровождающий:

Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
Andreas Tille
Sascha Steinbiss

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

scaffolding pre-assembled contigs after extension

SSAKE-based Scaffolding of Pre-Assembled Contigs after Extension (SSPACE) is a script able to extend and scaffold pre-assembled contigs using one or more mate pairs or paired-end libraries, or even a combination.

SSPACE is built based on SSAKE. Code of SSAKE is changed to be able to extend and scaffold pre-assembled contigs for multiple paired reads libraries.

This is the free 'basic' version of SSPACE. The non-free 'standard' version is available directly from Baseclear.

Другие пакеты, относящиеся к sspace

зависимости

рекомендации

предложения

dep: bowtie

Ultrafast memory-efficient short read aligner
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

Загрузка sspace

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	1 244,3 Кб	4651 Кб	[список файлов]

Sections